40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_19384 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  100 
 
 		 393 aa  816    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  39.32 
 
 		 632 aa  86.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  24.79 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  24.3 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  23.27 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  25.33 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  24.65 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  24.32 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  25.14 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  26.74 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  24.09 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  24.45 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  24.09 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  26.47 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  23.39 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  26.47 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  26.47 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  25.88 
 
 		 344 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  25.69 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  23.72 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  25.12 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  26.51 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  24.4 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  25 
 
 		 831 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  26.57 
 
 		 791 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  23.83 
 
 		 721 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  24.04 
 
 		 746 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  23.22 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  25.12 
 
 		 777 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  29.49 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  23.5 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  22.34 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  23.7 
 
 		 357 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  26.57 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  24.86 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  32.67 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  24.53 
 
 		 768 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  27.49 
 
 		 595 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  24.19 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>