81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3233 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  95.82 
 
 		 407 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  35.71 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  35.53 
 
 		 424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  33.75 
 
 		 406 aa  195  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  34.53 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  35.5 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  32.63 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  37.63 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  36.33 
 
 		 595 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  36.99 
 
 		 566 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  30.91 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  31.63 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  33.25 
 
 		 345 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  35.15 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  32.2 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  34.01 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  31.09 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  34.78 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  31.41 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  31.15 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  31.33 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  31.15 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  31.07 
 
 		 344 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  29.92 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 		 632 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  37.67 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  29.77 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  34.02 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  29.73 
 
 		 831 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  33.68 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  32.18 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  33.55 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  30.11 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  32.73 
 
 		 777 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  29.34 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  32.58 
 
 		 357 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  31.35 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  32.25 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  30.11 
 
 		 367 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  32.25 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  32.74 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  28.31 
 
 		 721 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  32.38 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  31.16 
 
 		 746 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  29.58 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  33.17 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  32.86 
 
 		 498 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  30.41 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  31.13 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  27.8 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.65 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  27.08 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  30.67 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  25.15 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.01 
 
 		 1338 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  31.15 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  26.92 
 
 		 791 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  34.48 
 
 		 335 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  31.78 
 
 		 1892 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  25.57 
 
 		 686 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  25.16 
 
 		 675 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  24.92 
 
 		 802 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 1118 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  27.51 
 
 		 513 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  32.98 
 
 		 308 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  24.81 
 
 		 698 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  29.1 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  32.23 
 
 		 733 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  25.83 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  24.92 
 
 		 768 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  27.78 
 
 		 815 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  24.54 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  28.08 
 
 		 969 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  28.95 
 
 		 740 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  24.54 
 
 		 960 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  30.51 
 
 		 726 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  26.89 
 
 		 963 aa  43.1  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>