72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1986 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  886    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  69.93 
 
 		 424 aa  628  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  64.92 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  51.11 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  45.07 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  37.8 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  33.01 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  32.63 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  34.22 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  30.07 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  30.07 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  30.07 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  30.77 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  30.07 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  29.83 
 
 		 344 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  29.83 
 
 		 345 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  30.07 
 
 		 345 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  29.36 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  29.36 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  30.07 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  34.29 
 
 		 595 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  30.36 
 
 		 371 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  34.6 
 
 		 566 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  32.01 
 
 		 349 aa  143  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  32.23 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  30.45 
 
 		 523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  33.65 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  32.61 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  31.87 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 456 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.98 
 
 		 514 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  30.57 
 
 		 777 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  27.76 
 
 		 831 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 632 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  28.46 
 
 		 721 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  29.97 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  32.7 
 
 		 746 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  34.98 
 
 		 503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  29.84 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  26.58 
 
 		 357 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  30.19 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  28.89 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  34.84 
 
 		 514 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  33.95 
 
 		 498 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  31.3 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  26.77 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  26.2 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  26.33 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  27.42 
 
 		 334 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  23.27 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  26.45 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  25.91 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  25.6 
 
 		 539 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  22.22 
 
 		 815 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  32.11 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  26.56 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  28.03 
 
 		 726 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  29.55 
 
 		 1892 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  32.17 
 
 		 768 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  23.37 
 
 		 791 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  25.88 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  27.91 
 
 		 675 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  25.43 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  32.74 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  26.67 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  33 
 
 		 436 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  25.19 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  30.33 
 
 		 530 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  27.7 
 
 		 733 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>