78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1365 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  100 
 
 		 341 aa  695    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  61.31 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  61.31 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  61.61 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  61.61 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  60.42 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  60.6 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  60.3 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  60.3 
 
 		 344 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  60.6 
 
 		 344 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  58.63 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  42.94 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  41.92 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  39.47 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  39.37 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  39.37 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  38.42 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  37.87 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  40.33 
 
 		 523 aa  205  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  40.68 
 
 		 530 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  34.22 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  35.24 
 
 		 416 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  31.31 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  38.32 
 
 		 411 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  36.34 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  33.23 
 
 		 424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  31.93 
 
 		 406 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  34.97 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  39.26 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  38.89 
 
 		 367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.63 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  31.47 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  33.44 
 
 		 595 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  31.64 
 
 		 721 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  38.31 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  32.53 
 
 		 432 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  33.55 
 
 		 777 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  34.62 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 		 456 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  32.69 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  31.27 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  31.19 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  28.53 
 
 		 831 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  34.95 
 
 		 746 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 632 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  31.19 
 
 		 503 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  32.88 
 
 		 514 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  30.59 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  31.02 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  35.57 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  30.5 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  26.28 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  25.82 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  25.69 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  32.2 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  28.42 
 
 		 726 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  27.82 
 
 		 686 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  26.77 
 
 		 462 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  30.6 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  29.59 
 
 		 768 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  28.16 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  47.06 
 
 		 1892 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  30.43 
 
 		 969 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  26.58 
 
 		 522 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  28.21 
 
 		 963 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  25.74 
 
 		 503 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  28.22 
 
 		 698 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  28.21 
 
 		 802 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  32.05 
 
 		 435 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  28.93 
 
 		 539 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  30.3 
 
 		 494 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  27.56 
 
 		 960 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  28.97 
 
 		 720 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  25.13 
 
 		 791 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.4 
 
 		 733 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  30.63 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  24.3 
 
 		 815 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>