64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0894 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  74.42 
 
 		 345 aa  558  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  73.84 
 
 		 345 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  73.84 
 
 		 345 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  73.26 
 
 		 345 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  73.26 
 
 		 344 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  72.97 
 
 		 344 aa  550  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  73.26 
 
 		 345 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  72.67 
 
 		 344 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  72.97 
 
 		 344 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  58.63 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  37.21 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  38.05 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  40.88 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  38.78 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  38.78 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  36.26 
 
 		 396 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  37.69 
 
 		 514 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  36.44 
 
 		 371 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  36.45 
 
 		 530 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  33.74 
 
 		 523 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  35.79 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  37.78 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  37.78 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  37.41 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  31.97 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  30.07 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  31.8 
 
 		 424 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  30 
 
 		 721 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  30.57 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  30.45 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  28.29 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  29.92 
 
 		 407 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  36.49 
 
 		 383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  32.88 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  30.56 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  29.74 
 
 		 595 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  32.06 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  32.79 
 
 		 566 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  31.49 
 
 		 777 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.47 
 
 		 831 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  28.86 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  29.6 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  33.23 
 
 		 746 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  31.8 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  32.87 
 
 		 514 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  31.48 
 
 		 520 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 		 632 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  30.05 
 
 		 503 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  32.86 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  27.97 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  28.32 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  26.53 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  26.51 
 
 		 393 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  28.87 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  26.69 
 
 		 1118 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  30.29 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.96 
 
 		 1892 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  23.43 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25.74 
 
 		 726 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  22.82 
 
 		 530 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  26.49 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>