53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0930 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  668    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  97.6 
 
 
334 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  50.76 
 
 
335 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  48.63 
 
 
342 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  32.74 
 
 
407 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  32.38 
 
 
407 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  27.68 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  28.5 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  26.86 
 
 
424 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  27.05 
 
 
456 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  31.37 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  28.15 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  28.48 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  28.47 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  27.1 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.32 
 
 
514 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  28.47 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 
632 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  27.4 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  24.91 
 
 
595 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  25.29 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  28.17 
 
 
416 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  25.29 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  29.53 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  25.7 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  26.47 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  25.61 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  25.3 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  26.69 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  27.96 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  25.3 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  25.3 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  27.18 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  26.12 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  25.76 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  27.18 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  24.4 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  26.96 
 
 
721 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  24.85 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  26.71 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  24.24 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  25.09 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  26.28 
 
 
341 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  29.15 
 
 
383 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  25.17 
 
 
367 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  29.37 
 
 
503 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  29.13 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  32.28 
 
 
520 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  30.16 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  25.29 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.91 
 
 
831 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  26.77 
 
 
514 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>