59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3072 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1204    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  45.21 
 
 		 566 aa  203  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  36.95 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  34.1 
 
 		 432 aa  160  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  35.56 
 
 		 420 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  33.42 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  33.77 
 
 		 406 aa  151  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  35.28 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  35.22 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  36.33 
 
 		 407 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  34.29 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  35.84 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  31.53 
 
 		 456 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  33.44 
 
 		 341 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  34.62 
 
 		 530 aa  140  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  36.58 
 
 		 364 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  29.52 
 
 		 344 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  30.72 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  30.7 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  30.64 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  29.52 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  31.42 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  30.03 
 
 		 345 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  35.03 
 
 		 514 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  31.51 
 
 		 347 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  33.75 
 
 		 416 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  29.21 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  30.06 
 
 		 345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  35.07 
 
 		 367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  35.07 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  34 
 
 		 367 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  28.89 
 
 		 344 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 		 411 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  33.79 
 
 		 357 aa  128  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  29.74 
 
 		 345 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  31.58 
 
 		 721 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  33.44 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  31.62 
 
 		 361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  30.37 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  32.66 
 
 		 337 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  32.66 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  32.8 
 
 		 777 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  27.46 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  30.38 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  29.02 
 
 		 831 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  30.94 
 
 		 746 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 		 632 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  30.28 
 
 		 474 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  32.16 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  29.63 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  28.83 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  25.18 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  24.56 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  26.5 
 
 		 335 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  22.65 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  28.16 
 
 		 1892 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  27.44 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  27.49 
 
 		 393 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>