58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0702 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  88.01 
 
 		 367 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  99.18 
 
 		 393 aa  738    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  54.11 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  54.31 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  45.82 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  47.32 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  37.41 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  36.4 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  36.3 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  36.3 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  35.34 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  35.11 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  35.11 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  35.11 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  35.11 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  34.14 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  38.89 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  36.54 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  36.46 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  34.7 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  34.7 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  32.26 
 
 		 523 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  35.64 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  34.41 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  34.31 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  35.07 
 
 		 595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  33.68 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  29.59 
 
 		 721 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  31.56 
 
 		 428 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  31.39 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  33.13 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  30.64 
 
 		 566 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  31.54 
 
 		 514 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  30.23 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  32.25 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  28.71 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  30.43 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  28.89 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  28.45 
 
 		 831 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  29.17 
 
 		 777 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 		 632 aa  82.8  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  28.03 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  30.81 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  29.09 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  28.64 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  27.18 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  26.83 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  28.23 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  28.84 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  27.4 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  28.37 
 
 		 726 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  26.51 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  30.52 
 
 		 733 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.74 
 
 		 935 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>