66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1004 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  97.97 
 
 
344 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  97.67 
 
 
344 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  88.08 
 
 
345 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  92.15 
 
 
345 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  97.97 
 
 
344 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  89.24 
 
 
345 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  88.95 
 
 
345 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  88.66 
 
 
345 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  73.26 
 
 
345 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  60.3 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  41.59 
 
 
349 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  39.28 
 
 
396 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  36.63 
 
 
347 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  38.89 
 
 
337 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  38.89 
 
 
337 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  39.23 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  36.68 
 
 
514 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  36.51 
 
 
371 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  37.54 
 
 
530 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  38.3 
 
 
523 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  36.65 
 
 
411 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  30.26 
 
 
424 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  30.07 
 
 
427 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  30 
 
 
420 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  37.64 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  33.65 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  36.54 
 
 
367 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  36.54 
 
 
393 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  31.51 
 
 
406 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  32.98 
 
 
407 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  33.46 
 
 
361 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  31.2 
 
 
721 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  28.18 
 
 
474 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  32.2 
 
 
407 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  29.52 
 
 
595 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  32.4 
 
 
432 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  35.71 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  34.08 
 
 
777 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  31.68 
 
 
383 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  34.26 
 
 
364 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
456 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  32.78 
 
 
566 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.92 
 
 
831 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  30.25 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  33.85 
 
 
746 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 
632 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  32.41 
 
 
520 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  32.41 
 
 
503 aa  92.8  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  30.99 
 
 
514 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  32.86 
 
 
498 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  25.61 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  25.61 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  25.48 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  26.47 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  28.51 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25 
 
 
726 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  25.89 
 
 
1118 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  28.65 
 
 
462 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.3 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  29.75 
 
 
453 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  28.57 
 
 
494 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  27.61 
 
 
698 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  25.11 
 
 
1892 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  27.65 
 
 
733 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 
615 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>