84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0553 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1075    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  44.74 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  39.85 
 
 		 530 aa  343  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  41.12 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  38.33 
 
 		 349 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  40.66 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  38.07 
 
 		 345 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  37.86 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  39.31 
 
 		 345 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  40.85 
 
 		 345 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  39.47 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  39.18 
 
 		 344 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  39.18 
 
 		 344 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  41.58 
 
 		 349 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  38.89 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  37.71 
 
 		 347 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  37.81 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  37.81 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  30.12 
 
 		 721 aa  189  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  38.44 
 
 		 371 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  34.66 
 
 		 345 aa  177  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  34.75 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  33.75 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  33.25 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  33.09 
 
 		 420 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  36.24 
 
 		 595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.26 
 
 		 831 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.59 
 
 		 432 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  30.79 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  35.33 
 
 		 407 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  33.53 
 
 		 367 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  35.6 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  33.53 
 
 		 393 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  35.43 
 
 		 777 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  36.42 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  33.23 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  30.36 
 
 		 364 aa  133  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  29.26 
 
 		 428 aa  127  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  33.56 
 
 		 383 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  34.16 
 
 		 357 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  31.63 
 
 		 746 aa  114  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  35.16 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  30.28 
 
 		 503 aa  90.9  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  29.38 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  36.43 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  27.94 
 
 		 686 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  30.52 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  27.84 
 
 		 675 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  26.99 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  27.68 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  31.43 
 
 		 791 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  30 
 
 		 342 aa  57  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  29.17 
 
 		 733 aa  57  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  24.91 
 
 		 577 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  24.91 
 
 		 577 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  24.91 
 
 		 577 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  28.45 
 
 		 768 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  31.31 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  26.03 
 
 		 802 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  26.97 
 
 		 726 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  27.67 
 
 		 539 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  26.6 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  26.92 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  24.23 
 
 		 963 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  29.22 
 
 		 740 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  25.9 
 
 		 698 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  26.18 
 
 		 530 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.86 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  23.77 
 
 		 969 aa  47  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  26.46 
 
 		 494 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.85 
 
 		 1338 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  26.14 
 
 		 800 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  28.38 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  28.18 
 
 		 882 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  29.38 
 
 		 815 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  25.57 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  26.01 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  28.31 
 
 		 308 aa  43.5  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>