51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5734 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1201    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1201    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1201    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  36.55 
 
 		 539 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  34.39 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  28.79 
 
 		 802 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  37.76 
 
 		 308 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  30.11 
 
 		 733 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  26.45 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  27.85 
 
 		 726 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  28.43 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  30.56 
 
 		 740 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  31.34 
 
 		 791 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  33.94 
 
 		 800 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  35.17 
 
 		 720 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  31.84 
 
 		 768 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  28.74 
 
 		 882 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  29.66 
 
 		 802 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  29.5 
 
 		 769 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  29.5 
 
 		 769 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  29.5 
 
 		 802 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  26.58 
 
 		 670 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  28.25 
 
 		 969 aa  77.4  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  26.95 
 
 		 963 aa  73.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  29.72 
 
 		 686 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  28.67 
 
 		 436 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  28.77 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  26.85 
 
 		 960 aa  70.1  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  28.14 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  27.88 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  30.61 
 
 		 764 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  27.99 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  32.92 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  26.02 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  26.02 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  26.27 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  27.38 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  26.73 
 
 		 1118 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  27.36 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  23.93 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  26.28 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  26.22 
 
 		 514 aa  55.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  27.91 
 
 		 1892 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  38.14 
 
 		 299 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 		 456 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  24.45 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  24.76 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  26.06 
 
 		 1338 aa  50.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  23.1 
 
 		 416 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  27.88 
 
 		 357 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  25.54 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>