70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0807 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  100 
 
 
686 aa  1399    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  39.6 
 
 
675 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  35.77 
 
 
522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  35.11 
 
 
494 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  32.35 
 
 
1118 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 
615 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  31.64 
 
 
435 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  31.51 
 
 
453 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  29.88 
 
 
436 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  31.05 
 
 
513 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  30.92 
 
 
436 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  32.62 
 
 
698 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  28.07 
 
 
485 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  36.97 
 
 
503 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  30.39 
 
 
802 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  29.21 
 
 
969 aa  91.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  40.13 
 
 
308 aa  87.8  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  28.25 
 
 
963 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  27.94 
 
 
960 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  30.49 
 
 
539 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  35.9 
 
 
530 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  33.55 
 
 
726 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.12 
 
 
514 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  30.88 
 
 
815 aa  74.3  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  29.72 
 
 
577 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  35.46 
 
 
720 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  29.72 
 
 
577 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  37.13 
 
 
800 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  29.72 
 
 
577 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  31.36 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.36 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  35.22 
 
 
733 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  27.17 
 
 
349 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  33.09 
 
 
740 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  28.04 
 
 
396 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  26.06 
 
 
411 aa  65.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  27.57 
 
 
523 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  28.48 
 
 
768 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  33.12 
 
 
791 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30.43 
 
 
1892 aa  61.6  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  34.19 
 
 
802 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  24.62 
 
 
371 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  34.19 
 
 
769 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  34.19 
 
 
769 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  34.19 
 
 
802 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  28.44 
 
 
349 aa  58.5  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  25.37 
 
 
347 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  32.1 
 
 
882 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  27.14 
 
 
530 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  35.94 
 
 
306 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  26.14 
 
 
721 aa  54.3  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  33.57 
 
 
1338 aa  53.9  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  27.82 
 
 
341 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  27.42 
 
 
764 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  24.47 
 
 
420 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  24.25 
 
 
416 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  25.57 
 
 
407 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  25.57 
 
 
407 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  27.13 
 
 
337 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  27.13 
 
 
337 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  30.61 
 
 
753 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  30.61 
 
 
753 aa  51.2  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  26.39 
 
 
764 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  30.94 
 
 
746 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  26.47 
 
 
432 aa  49.7  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  32.11 
 
 
427 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  33.02 
 
 
777 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  27.65 
 
 
670 aa  45.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  30.28 
 
 
424 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>