57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1584 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  99.74 
 
 
769 aa  1578    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  100 
 
 
769 aa  1582    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  99.74 
 
 
802 aa  1581    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  95.58 
 
 
802 aa  1453    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  78.02 
 
 
800 aa  1248    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  37.99 
 
 
740 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  38.27 
 
 
720 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  40.82 
 
 
299 aa  204  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  34.16 
 
 
802 aa  194  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  35 
 
 
815 aa  193  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  34.33 
 
 
791 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  32.21 
 
 
882 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  41.83 
 
 
726 aa  157  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  40.61 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  40.24 
 
 
733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  46.75 
 
 
539 aa  126  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  37.85 
 
 
530 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  41.95 
 
 
462 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  44.65 
 
 
308 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  29.81 
 
 
577 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  29.81 
 
 
577 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  29.81 
 
 
577 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  31.34 
 
 
753 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  31.34 
 
 
753 aa  94.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  28.35 
 
 
764 aa  87.8  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  28.79 
 
 
764 aa  87.4  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  30.77 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  39.84 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  35.85 
 
 
686 aa  70.5  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  34.39 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  36.02 
 
 
675 aa  69.3  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  36.92 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  35.44 
 
 
1118 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  30.84 
 
 
963 aa  67.8  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  30.63 
 
 
960 aa  65.1  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 
615 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  35.42 
 
 
494 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  38.35 
 
 
435 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  29.39 
 
 
969 aa  63.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  32.12 
 
 
513 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  36.64 
 
 
436 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  31.95 
 
 
503 aa  58.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  25.63 
 
 
1338 aa  57.4  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  29.71 
 
 
698 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  29.74 
 
 
1892 aa  56.6  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  26.71 
 
 
485 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  24.37 
 
 
349 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  31.37 
 
 
514 aa  51.2  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  27.49 
 
 
383 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  24.1 
 
 
345 aa  48.1  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  31.69 
 
 
407 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.69 
 
 
407 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  25.21 
 
 
367 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  27.23 
 
 
416 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  26.03 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  32.04 
 
 
306 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  25.25 
 
 
347 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>