57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3818 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1395    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  39.6 
 
 
686 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  32.34 
 
 
1118 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  34.01 
 
 
615 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  33.74 
 
 
494 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  32.69 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  34.16 
 
 
513 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  30.13 
 
 
435 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  29.71 
 
 
436 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  29.1 
 
 
485 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  30.53 
 
 
453 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  30.18 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  31.27 
 
 
698 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  32.94 
 
 
963 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  32.54 
 
 
969 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  29.02 
 
 
960 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  31.94 
 
 
802 aa  94.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  38.27 
 
 
503 aa  89.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  26.02 
 
 
815 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  30.39 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  38.81 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  37.42 
 
 
726 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  36.96 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  36.6 
 
 
800 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  34.06 
 
 
530 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  27.84 
 
 
523 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  35.26 
 
 
791 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  33.95 
 
 
768 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  36.3 
 
 
720 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  34.21 
 
 
733 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  31.41 
 
 
462 aa  65.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  32.92 
 
 
577 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  32.92 
 
 
577 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  32.92 
 
 
577 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  27.97 
 
 
306 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  35.57 
 
 
769 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  35.57 
 
 
769 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  35.57 
 
 
802 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  26.89 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  35.37 
 
 
802 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  32.08 
 
 
882 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  25.75 
 
 
371 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  30.88 
 
 
740 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  29.45 
 
 
1338 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  27.72 
 
 
670 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  31.97 
 
 
1892 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  25.16 
 
 
407 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  25.16 
 
 
407 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  26.25 
 
 
349 aa  50.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  28.57 
 
 
349 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  26.94 
 
 
347 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  22.9 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  27.08 
 
 
753 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  27.08 
 
 
753 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  27.91 
 
 
427 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  26.27 
 
 
416 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>