54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02034 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1482    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  98.3 
 
 		 299 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  44.14 
 
 		 740 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  37.97 
 
 		 800 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  38.27 
 
 		 769 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  38.27 
 
 		 802 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  38.27 
 
 		 769 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  37.68 
 
 		 802 aa  359  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  30.1 
 
 		 802 aa  220  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  32.63 
 
 		 791 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  34.13 
 
 		 726 aa  178  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  33.69 
 
 		 768 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  33.78 
 
 		 815 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  30.63 
 
 		 882 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  31.02 
 
 		 733 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  40.61 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  39.91 
 
 		 530 aa  144  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  37.34 
 
 		 462 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  47.22 
 
 		 308 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  32.59 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  32.59 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  32.59 
 
 		 577 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  25 
 
 		 670 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  35.71 
 
 		 436 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  33.71 
 
 		 764 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  33.71 
 
 		 764 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  29.2 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  29.2 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  34.42 
 
 		 436 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  36.25 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  35.46 
 
 		 686 aa  73.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  26.46 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 1118 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  30.25 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  36.3 
 
 		 675 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  30.63 
 
 		 513 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  29.01 
 
 		 522 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  27.44 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.53 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 514 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  30.43 
 
 		 1338 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  31.13 
 
 		 485 aa  55.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  29.34 
 
 		 969 aa  54.7  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  31.45 
 
 		 963 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  29.52 
 
 		 960 aa  51.6  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  25 
 
 		 523 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  24.62 
 
 		 349 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  28.97 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  23.3 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  29.1 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  29.2 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  23.32 
 
 		 345 aa  44.7  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>