36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0814 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  100 
 
 		 485 aa  961    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 		 1118 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  32.78 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  31.08 
 
 		 513 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.01 
 
 		 615 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  32.2 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  33.4 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  32.58 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  31.5 
 
 		 436 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  29.1 
 
 		 675 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  32.45 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  28.07 
 
 		 686 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.46 
 
 		 698 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  26.42 
 
 		 963 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  30.29 
 
 		 960 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  26.23 
 
 		 969 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  26.15 
 
 		 503 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  34.81 
 
 		 357 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  28.72 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  25.78 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  26.73 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  31.13 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  26.1 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  29.03 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  26.81 
 
 		 800 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30.86 
 
 		 1892 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  32.62 
 
 		 740 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  31.13 
 
 		 720 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  24.04 
 
 		 815 aa  54.3  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  30 
 
 		 726 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  29.57 
 
 		 306 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.85 
 
 		 733 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  26.11 
 
 		 768 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  24.5 
 
 		 769 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  24.5 
 
 		 769 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  24.5 
 
 		 802 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>