45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3334 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1071    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  40.45 
 
 		 1118 aa  293  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  36.81 
 
 		 494 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  36.82 
 
 		 522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  38.07 
 
 		 615 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  36.65 
 
 		 435 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  34.32 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  33.9 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  32.75 
 
 		 675 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  31.05 
 
 		 686 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  31.08 
 
 		 485 aa  183  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  35.24 
 
 		 698 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  29.62 
 
 		 963 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  26.51 
 
 		 969 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  28.1 
 
 		 503 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  28.76 
 
 		 960 aa  90.5  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  33.14 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.68 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  26.58 
 
 		 802 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  26.22 
 
 		 539 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  32.73 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  30.63 
 
 		 720 aa  63.9  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  32.86 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  26.7 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  26.7 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  26.7 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  32.86 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  31.03 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  26.73 
 
 		 670 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.63 
 
 		 1338 aa  57  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25.64 
 
 		 726 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  30.43 
 
 		 802 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  30.43 
 
 		 769 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  30.43 
 
 		 769 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  30.43 
 
 		 802 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  29.8 
 
 		 815 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  29.94 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.31 
 
 		 733 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  26.83 
 
 		 791 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  27.51 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  27.51 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  27.43 
 
 		 768 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  26.81 
 
 		 396 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.29 
 
 		 1892 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>