52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04689 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  100 
 
 		 740 aa  1528    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  44.14 
 
 		 720 aa  522  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  37.78 
 
 		 800 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  37.78 
 
 		 802 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  37.78 
 
 		 802 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  37.99 
 
 		 769 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  37.72 
 
 		 769 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  46.81 
 
 		 299 aa  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  33.69 
 
 		 802 aa  224  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  34.53 
 
 		 791 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  32.99 
 
 		 882 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  31.38 
 
 		 733 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  28.19 
 
 		 815 aa  190  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  31.12 
 
 		 726 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  31.25 
 
 		 768 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  39.26 
 
 		 539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  38.08 
 
 		 530 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  33.48 
 
 		 462 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  30.56 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  30.56 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  30.56 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  44.68 
 
 		 308 aa  107  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  24.87 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  30.08 
 
 		 764 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  29.17 
 
 		 764 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  26.98 
 
 		 753 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  26.98 
 
 		 753 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 615 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  34.32 
 
 		 1118 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  33.09 
 
 		 686 aa  67  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  32.12 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  32.12 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  33.55 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  35.2 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  31.03 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  28.34 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.57 
 
 		 1338 aa  58.9  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.23 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  29.01 
 
 		 503 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  30.72 
 
 		 969 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  30.88 
 
 		 675 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  29.35 
 
 		 963 aa  55.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  32.62 
 
 		 485 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 		 960 aa  53.9  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  26.58 
 
 		 514 aa  49.3  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  29.22 
 
 		 523 aa  48.5  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.34 
 
 		 1892 aa  47.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  23.75 
 
 		 349 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  23.01 
 
 		 416 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  28.95 
 
 		 407 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  28.95 
 
 		 407 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>