17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0663 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  35.09 
 
 
698 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  27.97 
 
 
675 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  32.74 
 
 
686 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  29.38 
 
 
513 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  36.19 
 
 
963 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  35.24 
 
 
1118 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  36.19 
 
 
960 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  36 
 
 
522 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  35.24 
 
 
969 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  30.19 
 
 
815 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  36 
 
 
494 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  34.29 
 
 
791 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  29.57 
 
 
485 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  26.47 
 
 
802 aa  45.8  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  32.35 
 
 
740 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  31 
 
 
503 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
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