21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0662 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  739    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  48.19 
 
 		 698 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  36.05 
 
 		 1118 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  34.81 
 
 		 485 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  34 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  29.78 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  30.64 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  30.39 
 
 		 675 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  31.36 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  33.1 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  30.91 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  31.29 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  31.52 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 		 960 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  30.59 
 
 		 503 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  29.89 
 
 		 963 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  30.87 
 
 		 969 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  27.88 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  27.88 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  27.88 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>