59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0711 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1449    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  48.19 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  34.6 
 
 		 306 aa  158  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 		 1118 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  32.62 
 
 		 686 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  31.27 
 
 		 675 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  30.12 
 
 		 615 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  30.06 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  30.38 
 
 		 494 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  30.46 
 
 		 485 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  30.1 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  31.43 
 
 		 969 aa  103  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  35.56 
 
 		 513 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  30.42 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  31.23 
 
 		 963 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  31.41 
 
 		 436 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.45 
 
 		 435 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  30.38 
 
 		 960 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  27.98 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  26.44 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.65 
 
 		 733 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  30.29 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  31.01 
 
 		 802 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  30.53 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  25.38 
 
 		 539 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  28.4 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  24.93 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  23.93 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  23.93 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  23.93 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  30.41 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  26.94 
 
 		 530 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  30.3 
 
 		 416 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  29.24 
 
 		 802 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  26.9 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.63 
 
 		 1338 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  28.65 
 
 		 815 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  26.74 
 
 		 349 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  28.65 
 
 		 769 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  28.65 
 
 		 769 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  28.65 
 
 		 802 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  51.6  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  25.37 
 
 		 407 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  24.81 
 
 		 407 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1651  cell wall hydrolase/autolysin  35.85 
 
 		 1504 aa  48.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  28.22 
 
 		 341 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  25.84 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30.46 
 
 		 1892 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  27.33 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  27.33 
 
 		 337 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  27.11 
 
 		 345 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  27.11 
 
 		 345 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  27.61 
 
 		 345 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  28.92 
 
 		 347 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  27.61 
 
 		 344 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  27.98 
 
 		 345 aa  44.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  27.11 
 
 		 345 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  25.72 
 
 		 523 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  26.99 
 
 		 344 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>