60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3479 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1080    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  78.34 
 
 		 494 aa  802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  40.08 
 
 		 1118 aa  289  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  39.62 
 
 		 615 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  36.82 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  37.21 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  37.66 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  36.86 
 
 		 436 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  37.66 
 
 		 436 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  35.77 
 
 		 686 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  32.69 
 
 		 675 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  32.78 
 
 		 485 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.84 
 
 		 698 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  30.4 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 969 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  33.01 
 
 		 963 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  31.39 
 
 		 960 aa  88.6  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  28.62 
 
 		 802 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  29.18 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  27.17 
 
 		 815 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0662  hypothetical protein  30.91 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.53388  normal  0.263798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  31.45 
 
 		 800 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  24.42 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  32.12 
 
 		 740 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.68 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25.29 
 
 		 726 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  29.01 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  25.07 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  31.13 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  29.27 
 
 		 791 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  28.27 
 
 		 1338 aa  60.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  29.85 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  32.45 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  32.45 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  32.45 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  32.45 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  26.28 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  26.28 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  26.28 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  26.18 
 
 		 882 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  36 
 
 		 306 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  27.71 
 
 		 349 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  26.58 
 
 		 341 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  28.95 
 
 		 337 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  28.95 
 
 		 337 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  24.91 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  24.74 
 
 		 764 aa  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.05 
 
 		 514 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  25.13 
 
 		 764 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  25.17 
 
 		 406 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  28.57 
 
 		 753 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 753 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  22.46 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  27.88 
 
 		 1892 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  24.54 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  26.92 
 
 		 523 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  25.43 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  28.87 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  24.71 
 
 		 345 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>