57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1795 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  100 
 
 
815 aa  1673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  36.95 
 
 
882 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  31.91 
 
 
791 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  34.57 
 
 
802 aa  211  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  29.93 
 
 
726 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  32.58 
 
 
733 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  28.19 
 
 
740 aa  190  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  33.49 
 
 
768 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  32.42 
 
 
800 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  33.78 
 
 
720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  35 
 
 
769 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  35 
 
 
802 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  35 
 
 
769 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  34.07 
 
 
539 aa  152  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  32.15 
 
 
530 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  43.78 
 
 
802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  45.75 
 
 
308 aa  124  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  28.43 
 
 
577 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  28.43 
 
 
577 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  28.43 
 
 
577 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.35 
 
 
462 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  31.6 
 
 
299 aa  101  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  27.75 
 
 
503 aa  89  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  29.89 
 
 
969 aa  80.9  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  26.02 
 
 
675 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  27.15 
 
 
764 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  27.7 
 
 
963 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  30.88 
 
 
686 aa  74.3  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  30.43 
 
 
764 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  27.79 
 
 
960 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  28.08 
 
 
753 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  28.08 
 
 
753 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  27.71 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  27.17 
 
 
522 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  25.87 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  25.07 
 
 
1118 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.12 
 
 
435 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  24.48 
 
 
670 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  25.38 
 
 
436 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  26.82 
 
 
615 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  54.3  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  24.04 
 
 
485 aa  54.3  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  28.65 
 
 
698 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  29.95 
 
 
513 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0663  hypothetical protein  30.19 
 
 
306 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280393  normal  0.716206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  23.69 
 
 
371 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  22.22 
 
 
427 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  26.83 
 
 
456 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  26.38 
 
 
514 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  25.86 
 
 
345 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  28.12 
 
 
420 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  23.14 
 
 
416 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  28.65 
 
 
1892 aa  45.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  27.78 
 
 
407 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  24.3 
 
 
341 aa  44.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  29.38 
 
 
523 aa  44.3  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>