71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0847 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  88.66 
 
 		 344 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  88.95 
 
 		 344 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  88.95 
 
 		 344 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  92.75 
 
 		 345 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  88.99 
 
 		 345 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  89.24 
 
 		 344 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  97.68 
 
 		 345 aa  710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  99.71 
 
 		 345 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  73.84 
 
 		 345 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  61.31 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  42.48 
 
 		 349 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  39.55 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  39.28 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  38.66 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  38.66 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  37.22 
 
 		 514 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  38.35 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  38.68 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  36.51 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  36.75 
 
 		 530 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  38.38 
 
 		 411 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  30.12 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  33.12 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  36.3 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  35.94 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  29.83 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  29.29 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  42.11 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  34.2 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  31.76 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  30.06 
 
 		 721 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  31.68 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.15 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  28.15 
 
 		 474 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  30.64 
 
 		 595 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  30.53 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  34.93 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  33.62 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  32.8 
 
 		 777 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  34.72 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  33.11 
 
 		 566 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.35 
 
 		 831 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  30.03 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  32.51 
 
 		 746 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 		 632 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  33.8 
 
 		 503 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  31.46 
 
 		 514 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  29.63 
 
 		 520 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  36.92 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  24.18 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  24.4 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  25.19 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.09 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  27.72 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  26.33 
 
 		 1118 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  24.4 
 
 		 726 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  30.62 
 
 		 615 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  25.17 
 
 		 530 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  28.84 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  28.85 
 
 		 435 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  27.11 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  30.38 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  26.04 
 
 		 539 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  28.08 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.46 
 
 		 1892 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  24.71 
 
 		 522 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  27.06 
 
 		 733 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  27.5 
 
 		 768 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  24.83 
 
 		 815 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>