35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3320 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1383    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  29.11 
 
 		 753 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  29.11 
 
 		 753 aa  172  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  34.11 
 
 		 764 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  33.77 
 
 		 764 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  29.97 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  26.54 
 
 		 530 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  25.31 
 
 		 726 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  26.73 
 
 		 462 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  26.54 
 
 		 791 aa  87.4  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  34.16 
 
 		 720 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  26.58 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  26.58 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  26.58 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  28.22 
 
 		 308 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  24.87 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  30.32 
 
 		 800 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  25.36 
 
 		 802 aa  71.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.84 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  24.95 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  28.28 
 
 		 768 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  29.73 
 
 		 769 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  29.73 
 
 		 802 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  29.73 
 
 		 769 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  30.73 
 
 		 802 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  26.73 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  27.72 
 
 		 675 aa  55.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  28.5 
 
 		 436 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  28.01 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  42.19 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  28.98 
 
 		 615 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  27.98 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  29.65 
 
 		 435 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  27.65 
 
 		 686 aa  45.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  27.08 
 
 		 436 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>