52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1078 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1047    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  61.52 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  60 
 
 
520 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  57.14 
 
 
498 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  48.19 
 
 
474 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  35.37 
 
 
424 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  34.84 
 
 
427 aa  100  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  33.33 
 
 
420 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  32.87 
 
 
345 aa  97.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  31.92 
 
 
345 aa  93.2  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  31.46 
 
 
344 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  31.46 
 
 
344 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  31.46 
 
 
344 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  31.9 
 
 
595 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  30.99 
 
 
344 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  30.56 
 
 
432 aa  90.1  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  31.46 
 
 
345 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  31.46 
 
 
345 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  31.46 
 
 
345 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  30.99 
 
 
345 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  32.88 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  32.08 
 
 
831 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  28.76 
 
 
721 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  29.77 
 
 
566 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  35.94 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.13 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  30.66 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  26.32 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  31.51 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  31.94 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  30.41 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  31.94 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  28.96 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 
632 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  30.52 
 
 
523 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 
411 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  28.77 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  31.51 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  31.3 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  27.11 
 
 
396 aa  67  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  28.95 
 
 
777 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  25.96 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  38.18 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  28.7 
 
 
367 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  27.6 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  27.4 
 
 
367 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  27.4 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  31.5 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  30.7 
 
 
746 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  30.71 
 
 
361 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30.84 
 
 
1892 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  34.94 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>