39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_26963 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  94.69 
 
 		 261 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  70.63 
 
 		 264 aa  358  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  63.53 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  57.89 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  57.51 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  41.57 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  45.45 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  43.18 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.08 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  40.91 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  53.57 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  42.05 
 
 		 149 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  37.08 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  39.56 
 
 		 136 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  39.56 
 
 		 136 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  37.5 
 
 		 128 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  46.43 
 
 		 130 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  37.36 
 
 		 136 aa  52.4  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  38.46 
 
 		 136 aa  52  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  39.71 
 
 		 125 aa  52  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  40.28 
 
 		 122 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  35.9 
 
 		 120 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  27.37 
 
 		 171 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  39.29 
 
 		 117 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  39.29 
 
 		 122 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  36.84 
 
 		 154 aa  46.6  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  36.36 
 
 		 120 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  35.71 
 
 		 126 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  32.35 
 
 		 122 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  39.29 
 
 		 120 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  35.71 
 
 		 120 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  30.85 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.71 
 
 		 120 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  34.48 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  35.71 
 
 		 122 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  37.5 
 
 		 122 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.5 
 
 		 120 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  34.55 
 
 		 123 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>