77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2132 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  72.8 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  64.46 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  61.79 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  60.98 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  60.66 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  58.68 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  56.78 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  58.12 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  66.13 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  57.76 
 
 		 120 aa  143  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  57.14 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  58.62 
 
 		 117 aa  141  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  54.24 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  59.5 
 
 		 122 aa  139  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  54.24 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  57.89 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  53.45 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  54.62 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  49.59 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  58.41 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  54.47 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  58.54 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  55.36 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  53.21 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  49.14 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  49.14 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  49.14 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  40.23 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  39.77 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  40.91 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  32.79 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  34.78 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  34.09 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  41.77 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  43.37 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.35 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.65 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.71 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  42.03 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  27.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.71 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  38.6 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  39.13 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.87 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.87 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  39.71 
 
 		 261 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  39.71 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  35.14 
 
 		 259 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  37.18 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  38.46 
 
 		 266 aa  50.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  31.25 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  38.46 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  42.42 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  34.29 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.82 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.84 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  35.14 
 
 		 264 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.73 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  36.36 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.94 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.23 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  36.78 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  33.72 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04073  40S ribosomal protein S12 (Broad)  40.68 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.713259  normal  0.323926 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  34.44 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91009  predicted protein  32.58 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  36.96 
 
 		 98 aa  43.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  29.67 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12596  Ribosomal protein S12, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.86 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.727796  normal  0.5347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  34.78 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  34.78 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  33.73 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.74 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  26.09 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.76 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.82 
 
 		 82 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>