53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1236 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  55.93 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  55.93 
 
 		 169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  57.98 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  54.7 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  52.54 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  58.41 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  51.26 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  53.78 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  51.26 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  47.46 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  64.29 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  48.36 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  47.86 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  52.94 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.54 
 
 		 120 aa  117  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  47.06 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  41.53 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  41.53 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  47.9 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  45.38 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.14 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  45.38 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  45.38 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  45.38 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  44.63 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  42.98 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  43.8 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  40.91 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  36.61 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  33.06 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  40.51 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  33.98 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  38.32 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  35.87 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.89 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  29.51 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  38.2 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  35.53 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  37.08 
 
 		 253 aa  60.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  35.42 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  45.45 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  29.17 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  34.26 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34756  predicted protein  27.66 
 
 		 214 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.351945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.81 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.1 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.96 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87137  predicted protein  27.19 
 
 		 524 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.253104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.43 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  36.14 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  37.68 
 
 		 83 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  24.74 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>