42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41236 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  100 
 
 
126 aa  255  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  76.67 
 
 
123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  74.6 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  75.2 
 
 
127 aa  196  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  65.08 
 
 
126 aa  147  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  40.19 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  40.59 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  38.18 
 
 
164 aa  87  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  41.35 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.68 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  41.24 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  45.88 
 
 
169 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  48.65 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  41.24 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  41.77 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  40.21 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  40.21 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  43.84 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  47.37 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  39.18 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  38.3 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  35.14 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  36.08 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.23 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  41.94 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  33.33 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  36.63 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.26 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  53.45 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  34.23 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.43 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  32.43 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  36.67 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  36.28 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  39.73 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  35.05 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.197581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  32 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  40.66 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.29 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.33 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  35 
 
 
83 aa  41.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  35.59 
 
 
266 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>