52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0248 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 
136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 
136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  99.26 
 
 
136 aa  266  8e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  91.91 
 
 
136 aa  249  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  73.5 
 
 
117 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  55.46 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  47.37 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  47.76 
 
 
151 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 
153 aa  114  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  45.52 
 
 
169 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  45.38 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  49.14 
 
 
125 aa  107  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  45.76 
 
 
122 aa  104  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  45.83 
 
 
120 aa  102  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 
122 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  43.24 
 
 
128 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  47.93 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  45.83 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  44.17 
 
 
120 aa  98.2  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  50.85 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  49.15 
 
 
129 aa  97.4  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  47.46 
 
 
122 aa  97.1  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.54 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  45.3 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.17 
 
 
120 aa  94  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  44.86 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  44.17 
 
 
120 aa  91.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  44.92 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  31.58 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  41.05 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  35.96 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  40 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  36.84 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  40.21 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  32.56 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  33.33 
 
 
224 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  33.33 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  32.93 
 
 
225 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  39.56 
 
 
253 aa  53.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  38.46 
 
 
261 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.71 
 
 
254 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.18 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  30.39 
 
 
264 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.76 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  32.91 
 
 
259 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  31.15 
 
 
266 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.76 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  31.03 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  32.1 
 
 
83 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  34.57 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.8 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.8 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>