53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0721 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 122 aa  239  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  78.51 
 
 		 122 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  77.69 
 
 		 122 aa  192  9e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  78.63 
 
 		 122 aa  188  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  72.73 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  64.1 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  58.97 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  58.68 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  58.97 
 
 		 120 aa  147  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  57.26 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  55.17 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  60.34 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  60.34 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  58.26 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  55.74 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  49.57 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  47.54 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  48.36 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  52.54 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  53.57 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  59.76 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  43.59 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  37.62 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  32.69 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  37.65 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  32.23 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  35.29 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  39.13 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  39.73 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.68 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  37.31 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  31.58 
 
 		 171 aa  50.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  25.84 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  25.42 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  35.29 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.76 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  39.29 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  39.29 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  36.76 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  29 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  35.71 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  33.73 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.59 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  31.75 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  34.78 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  34.85 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  25 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>