62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0589 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 
169 aa  336  9e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  91.22 
 
 
151 aa  276  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  91.95 
 
 
153 aa  275  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  91.84 
 
 
149 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  64.63 
 
 
164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  72.8 
 
 
129 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  59.84 
 
 
130 aa  157  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  60.66 
 
 
125 aa  157  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  58.33 
 
 
122 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  55.46 
 
 
120 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  52.94 
 
 
120 aa  140  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  55.46 
 
 
120 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  55.93 
 
 
121 aa  137  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  50.41 
 
 
128 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  50 
 
 
120 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  50.43 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 
117 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  50.43 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 
122 aa  124  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  47.9 
 
 
122 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  55.08 
 
 
117 aa  122  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  50 
 
 
122 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  49.58 
 
 
136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  45.52 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  45.52 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  45.52 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  45.38 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  37.84 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  39.62 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  39.64 
 
 
123 aa  88.6  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  42.55 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  48.1 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  45.88 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  40 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  45.76 
 
 
149 aa  62  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.21 
 
 
82 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  49.25 
 
 
80 aa  60.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  40.91 
 
 
253 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  37.5 
 
 
254 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  39.77 
 
 
261 aa  58.9  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.58 
 
 
84 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  38.32 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  44.93 
 
 
266 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  31.43 
 
 
224 aa  55.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  42.25 
 
 
259 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  35.05 
 
 
264 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  40.79 
 
 
83 aa  51.6  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  40.96 
 
 
79 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.35 
 
 
94 aa  51.2  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  39.13 
 
 
83 aa  50.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  40 
 
 
82 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  40 
 
 
82 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  42.65 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.71 
 
 
82 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.21 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.21 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.03 
 
 
86 aa  44.3  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.89 
 
 
103 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  30.68 
 
 
116 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  38.46 
 
 
84 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>