57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1846 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 164 aa  333  7.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  64.63 
 
 		 169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  64.14 
 
 		 151 aa  204  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  62.76 
 
 		 153 aa  201  5e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  60.96 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  56.8 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  55.93 
 
 		 121 aa  138  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  50.83 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  54.62 
 
 		 125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  50.41 
 
 		 122 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  47.9 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  50.42 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  47.9 
 
 		 120 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  48.87 
 
 		 136 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  51.28 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  52.54 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  47.37 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  47.37 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  47.37 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  45.45 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47.86 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  45.69 
 
 		 117 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  44.44 
 
 		 122 aa  111  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  43.59 
 
 		 122 aa  111  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  44.35 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  45.3 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  41.88 
 
 		 122 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  41.53 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  43.96 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  42.7 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  36.13 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  36.84 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.23 
 
 		 254 aa  70.5  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  39.64 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  38.18 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  41.57 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  41.57 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  41.67 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  46.58 
 
 		 259 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  45.21 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  37.5 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  49.15 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  32.74 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.68 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  28.8 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.05 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.22 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.22 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.81 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  36.78 
 
 		 83 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.53 
 
 		 104 aa  44.7  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  31.4 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  36.96 
 
 		 95 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  32.52 
 
 		 306 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.98 
 
 		 94 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  34.12 
 
 		 82 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  33.33 
 
 		 82 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>