48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0523 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  78.51 
 
 		 122 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  77.69 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  76.07 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  68.85 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  62.39 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  57.14 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  62.28 
 
 		 120 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  56.41 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  53.66 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  56.41 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  57.76 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  52.59 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  56.03 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  51.28 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  47.01 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  45.3 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  43.9 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  50.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  44.44 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.8 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  53.66 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  46.9 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  43.93 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  44.86 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  44.86 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  44.86 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  37.86 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  35.71 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  39.02 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  32.65 
 
 		 154 aa  67  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  39.19 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  32.69 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  29.17 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  28 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  28.12 
 
 		 224 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  39.44 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  35.82 
 
 		 266 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.88 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.94 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8686  predicted protein  33.33 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.65 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  37.5 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  35.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  32.81 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.35 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>