32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01710 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  100 
 
 		 225 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  49.01 
 
 		 154 aa  128  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  58.25 
 
 		 149 aa  99  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  42.18 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  49.24 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  32.06 
 
 		 126 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  29.01 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.51 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  30.25 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  35.37 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.78 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  32.74 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  33.33 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  37.86 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  34.19 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  38.32 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  32.18 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  32.71 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  34.15 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  32.93 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  32.93 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  44.26 
 
 		 129 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  37.7 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  36.28 
 
 		 126 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  31.25 
 
 		 125 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  25.56 
 
 		 120 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  28.24 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  29.21 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  26.97 
 
 		 120 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  23.76 
 
 		 120 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  28.85 
 
 		 120 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  25 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>