45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01500 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG01500  snRNP subunit, putative  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53138  predicted protein  75.59 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9983  predicted protein  75 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41236  predicted protein  75.2 
 
 		 126 aa  176  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01319  snRNP and snoRNP protein (Snu13), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05950)  65.55 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010186  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.74 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  43.64 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  40.54 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  44.94 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  41.82 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  37.84 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1846  50S ribosomal protein L7Ae  42.7 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79967  predicted protein  40.66 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  39.77 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  39.6 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  43.18 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.61 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0523  50S ribosomal protein L7Ae  37.86 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1497  50S ribosomal protein L7Ae  38.18 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.122049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  34.23 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  37.62 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0443  50S ribosomal protein L7Ae  43.42 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  34.23 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0690  50S ribosomal protein L7Ae  39.18 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.197581 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0493  50S ribosomal protein L7Ae  43.48 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  34.55 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  41.77 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  40.22 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  41.05 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  41.05 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.82 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  41.05 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  32.43 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36743  predicted protein  37.08 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931628  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17769  predicted protein  39.36 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000637772  hitchhiker  0.00579454 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00695  small nuclear ribonucleoprotein complex protein Nhp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13570)  30.97 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01710  nucleolar protein family A member 2, putative  29.01 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41276  Ribosomal protein L7a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.29 
 
 		 254 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02040  ribosomal protein L4, putative  38.46 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.637781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86627  ribosomal protein L8B (L4B) (rp6) (YL5)  30.85 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0378292  normal  0.472149 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_26963  60S ribosomal protein L7A  30.85 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23079  predicted protein  31.58 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.740425  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05520  cytosolic large ribosomal subunit protein L7A (AFU_orthologue; AFUA_6G12990)  33.93 
 
 		 264 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.32412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>