41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3677 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 98 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  46.81 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.55 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  43.88 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.62 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.56 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.46 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.43 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.43 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  43.01 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.11 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.21 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  40 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.42 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  41.3 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  40.86 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  38.04 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  37.78 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  37.78 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  28.72 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  28.72 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  35.87 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  35.87 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  36.84 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  38.46 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  32.22 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  31.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  31.11 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  37.76 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  34.21 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1236  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  24.74 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.47 
 
 		 104 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>