37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0380 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  202  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  74.75 
 
 
100 aa  156  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  56.57 
 
 
101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  44.44 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  42 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  44.57 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  42.39 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  44.21 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.54 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.54 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  34.74 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  40.22 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0432  50S ribosomal protein L7AE  37.08 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.899191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  35.05 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  33.68 
 
 
200 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  28.12 
 
 
197 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.96 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  36.05 
 
 
99 aa  52  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  33.33 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.47 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.89 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.22 
 
 
98 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  23.96 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.12 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29 
 
 
120 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  31.33 
 
 
212 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>