47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0813 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  100 
 
 		 103 aa  201  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  44.21 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  32.63 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0432  50S ribosomal protein L7AE  33.71 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.899191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  36.27 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  36.36 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  28.26 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  28.26 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.32 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.05 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.05 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.38 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  27.96 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  33.68 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  31.37 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.04 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.11 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.46 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.46 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  32.97 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.3 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.11 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  31.4 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  31.4 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  30 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  28.28 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.75 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  29.07 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  29.89 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.89 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  31.58 
 
 		 205 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  41.2  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  26.88 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  28.72 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>