42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0698 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  50.52 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  43.56 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  47.87 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  45.56 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  44.57 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  45.56 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  44.44 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.8 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.8 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  37.37 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  42.68 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.53 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  30.69 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.63 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  27.96 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  31.37 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.17 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  34.09 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.05 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  30.21 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  30.21 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0432  50S ribosomal protein L7AE  31.03 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.899191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.56 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  32.65 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.07 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0334  ribosomal protein L7A family protein  36.36 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.11 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  24.18 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  24.18 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>