22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0334 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0334  ribosomal protein L7A family protein  100 
 
 
99 aa  192  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  61.62 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  35.16 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  32.97 
 
 
103 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  32.63 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  25 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  36.36 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  35.79 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.11 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.21 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  37.97 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.08 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  32.98 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>