47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2046 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  73 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  66.32 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  65.26 
 
 		 103 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  63.16 
 
 		 103 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  63.16 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  42 
 
 		 101 aa  101  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  45 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  44.57 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  44.57 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.3 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  40.2 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.37 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.89 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.64 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.3 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  38 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  36.73 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  33.67 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.18 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.04 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  38.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.96 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.56 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  34 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  29.29 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  29.29 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  28.26 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  28.26 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  37.08 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  33.68 
 
 		 103 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  35.05 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  31.75 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  31.68 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0334  ribosomal protein L7A family protein  25 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  23.71 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  34.38 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>