61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3780 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  49.48 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  46.5 
 
 		 202 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  46 
 
 		 210 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  46 
 
 		 202 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  46.23 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  45.64 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  43 
 
 		 212 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  46.03 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  40.31 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  39.77 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  43 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  37.38 
 
 		 275 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  35.82 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  38.81 
 
 		 234 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  39.66 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  36.56 
 
 		 194 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  37.43 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  34.65 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  36.41 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  39.18 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  36.76 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  36.65 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  38.98 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  40 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  37.63 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  35.71 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  36.13 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  38.98 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  38.38 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  36.78 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  34.95 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  37.7 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  35.27 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  34.9 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  38.42 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  34.72 
 
 		 200 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  33.98 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  30.77 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  35.75 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  31.66 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  30.05 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  31.32 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  31.67 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  38.41 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  31.67 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  42.2 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  28.89 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2205  protein of unknown function DUF448  41.79 
 
 		 139 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000579062  decreased coverage  0.000388749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1509  protein of unknown function DUF448  36.73 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  31.18 
 
 		 100 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  30.59 
 
 		 95 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  31.65 
 
 		 95 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.84 
 
 		 119 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  31.25 
 
 		 100 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.84 
 
 		 115 aa  42  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>