47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1941 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  100 
 
 		 100 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.56 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.79 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.79 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  34.41 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  32 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.93 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  28.26 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  28.89 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0256  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.37 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.72 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  32.58 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.42 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  28.26 
 
 		 102 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.85 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.27 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  34.04 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  26.88 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  28.43 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl294  ribosomal protein L7A family protein  32.95 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  22.34 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  26.6 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  26.09 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  23.23 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0152  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  26.09 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  27.06 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  21.35 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  27.06 
 
 		 197 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  27.85 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  26.51 
 
 		 197 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  25.26 
 
 		 200 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  25.49 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  27.17 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  24.18 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  21.28 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>