15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0256 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0256  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 108 aa  216  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0530  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  51.52 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0152  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  46.39 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.21 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0621  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.43 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000359696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  27.37 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  27.37 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.63 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  35.23 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.28 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  26.8 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  26 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  26 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  29.55 
 
 		 200 aa  40.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.84 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>