50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0456 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0992  50S ribosomal protein L7AE  51.82 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1154  hypothetical protein  44.33 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2775  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  52.44 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000786101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2046  hypothetical protein  37.37 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3636  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00050077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3189  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.39 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000958569  normal  0.145254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2466  hypothetical protein  37.23 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000938075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3861  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3912  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0236889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3826  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3951  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00360527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3573  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00318264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3555  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3665  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000505852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3852  hypothetical protein  36 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0106157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1332  hypothetical protein  35 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000143752  hitchhiker  0.0000753067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1646  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.63 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0039527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1663  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.04 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000334111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1354  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.71 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1328  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.71 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0835  30S ribosomal protein L7Ae, putative  36.46 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0925  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.31 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00222099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1443  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.38 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00290557  normal  0.16592 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0816  hypothetical protein  30.93 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.560266  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0382  hypothetical protein  36.46 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.724071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1049  50S ribosomal protein L7AE  39.33 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000677595  unclonable  0.0000000101124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3677  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.42 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1958  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.63 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.268477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1941  ribosomal protein L7Ae family protein  33 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1659  ribosomal protein L7Ae family protein  33 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0698  50S ribosomal protein L7AE  30.53 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000137863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  32.04 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0380  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  30.11 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  30.39 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  32.58 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  32.58 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0432  50S ribosomal protein L7AE  46.67 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.899191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  33.33 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  30.48 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  36.05 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0152  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.53 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0154  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  26.8 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931846  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  27.38 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  27.38 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1356  50S ribosomal protein L7AE  28.12 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  34.62 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0256  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.84 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.405727  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  26.19 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>