32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0372 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  100 
 
 		 96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  58.51 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  53.19 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  47.31 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  49.46 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  49.46 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  38.04 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  37.89 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.74 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  40 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  37.23 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0700  50S ribosomal protein L30e  36.46 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0156911  normal  0.0492944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.38 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2094  50S ribosomal protein L30e  38.54 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1966  50S ribosomal protein L30e  36.46 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000573809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.99 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2324  50S ribosomal protein L30e  34.38 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00112363  decreased coverage  0.00000131397 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.46 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  33.33 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.7 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43840  predicted protein  32.98 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.881392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  32.32 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  32.32 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  30.3 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  31.52 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  29.35 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  31.31 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  27.08 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  36.36 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.57 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0456  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.62 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.11 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>