29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0036 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  100 
 
 		 103 aa  200  5e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  60.2 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  42.42 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  44.33 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  40.4 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  40.4 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  42.42 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  43.48 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.36 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  41.94 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  34.69 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43840  predicted protein  38.54 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.881392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  36.08 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2324  50S ribosomal protein L30e  39 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00112363  decreased coverage  0.00000131397 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2094  50S ribosomal protein L30e  39.56 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1966  50S ribosomal protein L30e  38.54 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000573809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  37.63 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.26 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0700  50S ribosomal protein L30e  38.46 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0156911  normal  0.0492944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.46 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  32.29 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  32.61 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.05 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.05 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  35.29 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  29.89 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.07 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  27.08 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  25.27 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>