30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0675 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0675  50S ribosomal protein L30e  100 
 
 
105 aa  216  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0213  50S ribosomal protein L30e  94.29 
 
 
106 aa  207  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0610  50S ribosomal protein L30e  93.33 
 
 
106 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1308  50S ribosomal protein L30e  93.33 
 
 
106 aa  205  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0787  50S ribosomal protein L30e  76.53 
 
 
107 aa  159  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2094  50S ribosomal protein L30e  43.75 
 
 
101 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0031  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.41 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0700  50S ribosomal protein L30e  45.83 
 
 
101 aa  87  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0156911  normal  0.0492944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1201  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  41.94 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2324  50S ribosomal protein L30e  42.86 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00112363  decreased coverage  0.00000131397 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1966  50S ribosomal protein L30e  43.75 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000000573809  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0283  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  43.48 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0320  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.46 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259957  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1930  50S ribosomal protein L30e  39.58 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0294284  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0036  50S ribosomal protein L30e  42.42 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000178932  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30944  predicted protein  44.09 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.212607  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0302  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.11 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0525358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0316  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.11 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0054  50S ribosomal protein L30e  38.14 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0738724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3690  50S ribosomal protein L30e  35.35 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.248042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2163  50S ribosomal protein L30e  37.37 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0171744  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37627  Ribosomal protein L30, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.78 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167554  normal  0.0307428 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06082  60S ribosomal protein L30, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09200)  38.71 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1088  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  38.95 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.342789  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02220  60s ribosomal protein l30-1 (l32), putative  34.41 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0493078  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43840  predicted protein  30.43 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.881392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1175  50S ribosomal protein L30e  29.59 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000129026  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0372  50S ribosomal protein L30E  31.31 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0352  50S ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  28.4 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  31.91 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>